Les deux sections furent mises en service respectivement en 1916 et 1921 par la (C.F.E.J.) Compagnie des Chemins de Fer Electriques du Jura. La ligne était exploitée avec banalisation du matériel roulant, les personnels français et suisse ne quittant pas leur pays. En 1945 la ligne fût réouverte mais les trains internationaux directs Morez-Nyon ne reprirent quen 1948, avec cette fois deux exploitations distinctes, suisse et française. En 1958, la partie française déficitaire fût fermée et remplacée par un service dautocar.
Deux à trois navettes quotidiennes parcouraient la section française. On pouvait acheter en Grande-Bretagne des billets pour Nyon à cela près que les bagages eux devaient transiter par le PLM (sans doute à cause de la frontière). On délivrait à Morez des billets mixtes fer-bateau pour évoluer sur le lac Léman.
La ligne desservait les gares de Morez, Les Rousses, La Cure, St Cergue et Nyon où elle rejoignait la ligne Genève - Lausanne. A partir de Morez où elle prenait naissance dans la cour de la gare de voyageurs, elle traversait le bourg et suivait la nationale 5 en accotement (on peut encore aujourdhui voir le percement de deux tunnels en courbes sur cette section). La rampe de 60 à 70 mm/m était constante.
La ligne était électrifiée en courant continu de 2200V et exploitée au début par des automotrices suisses Brown-Boveri à bogie munies de 4 moteurs de 100 ch et pouvaient atteindre la vitesse de 45 km/h. Après la fermeture de la section française, les automotrices furent cédées à la partie suisse où elles ont circulé jusque dans lss années 80. Aujourdhui ces automotrices et leurs remorques sont sur le Chemin de Fer de La Mure où elles circulent après avoir subi une adaptation de courant.
La motrice Brown-Boveri 11 sur son réseau dorigine. Au fond la 2. | La 11 vient de quitter la station avec sa remorque. |
Aujourdhui le matériel ancien a été récupéré par le SGLM qui lexploite en tourisitque. |